龜山之地名，說法有二。一說因本區壽山嚴觀音廟前，有一山丘，狀如龜形。緣此，昔時嶺頂稱為龜崙頂，而舊區公所一帶稱為龜崙口，乃平埔族龜社之原住民(Cournangh)聚居之所，山以社音得名。另說法則認為與地形有關。蓋龜山區之地形係由一丘陵台地合成。丘陵即東南部之龜崙嶺丘陵，是介於台北盆地和新莊斷層之間，作東北東，西南西走向之獨立地塊；台地即西北部之林口台地，高度約在海拔240至260公尺之間，傾斜度很小，面向西北伸延至蘆竹區和林口區。從空中鳥瞰，丘陵似龜首，台地似龜甲。故名「龜山」。
本區轄區內的小地名，係漢人入墾龜山區後始命地名，所命地名甚具地理意義，地名顯示地形、地緣、天然植物、灌溉設施、道路、歷史痕跡，茲分述如下：
一、地形狀況命名者：
(一)有低窪或凹地叫坑：兔仔坑、楓樹坑、舊路坑、新路坑、塔寮坑等。
(二)有丘陵線叫嶺：如關公嶺、新潮嶺、嶺頂、龜崙嶺。
二、依農墾和水利命名者：大湖頂、西勢湖、坪頂下湖、坪頂頂湖、坪頂大湖。
三、依植物命名者：楓樹坑、苦苓林、大菁坑、員林坑、樟腦寮。
四、依灌溉設施命名者：如牛角坡、埤寮、水尾。
五、依道路設施命者：舊路坑、新路坑。
六、依原住民聚落命名者：社后坑、下社、頂社、蕃仔窩(分為大番仔窩、小番仔窩、番社)。
七、依血緣聚落命名者：蕭厝坑、劉厝坑、張厝、陳厝坑。
八、依礦物命名者：兔坑原名炭坑。
九、依氣候命名者：風尾。
十、依防匪防盜之設施而成聚落命名者：塔寮坑。
行政沿革與組織
龜山區早期稱龜崙社，二戰後民國三十四年改為新竹縣桃園區龜山鄉，民國三十九年桃園設縣而更名為桃園縣龜山鄉，村里行政組織共分為新路、龜山、山頂、兔坑、楓樹、舊路、公西、大崗、南上、大坑、嶺頂、龍壽、牛角等十三個村。
民國五十五年，自新路村分出陸光村。民國五十七年自楓樹村分出精忠村。民國七十一年自龜山村分出大同村，新路村再分出中興村，山頂村再分出山福村，山德村等合計十九村。
民國八十七年八月，本區因為工商業持續發展，人口快速增加，行政區域再擴編為廿六村。增加了新嶺、幸福、文化、南美、福源、迴龍、龍華等村。
民國九十一年十月，由於本區大坪頂地區土地重劃，開發快速，人口持續增加，行政區域再擴增了大華、大湖、新興、長庚村，使得本區的村里行政組織增加為三十個村。
依公所組織自治條例，原鄉公所設有民政、財政、工務、社會、城鄉經建課、文化發展課（備註）
及人事、主計、政風、行政室等課室，以及清潔隊、托兒所、養護工程所、路燈管理所等附屬單位。
民國103年12月升格改制為龜山區，依「桃園市各區公所組織規程」成立秘書室、會計室、政風室、人事室、人文課、民政課、農經課、社會課及工務課等9單位。
備註：為有效推動區內各項藝文建設，95年時公所調整組織編制，將課室和圖書館有關文化及教育相關業務整併，率先全國區之先成立『文化發展課』，以有效落實各項人文教育建設。